川崎病的预后要决定于，儿童川崎病心血管并发症的严重程度，如果患儿川崎病没有严重的心血管受累，冠状动脉还有心脏彩超结构和功能都是正常，这部分川崎病是可以得到痊愈。
如果患儿川崎病早期比较难治，是个难治性的川崎病，合并严重的心血管受累，尤其是合并严重的冠状动脉病变，这部分患儿可能会遗留一部分心血管的并发症或者后遗症，比如冠状动脉扩张，甚至冠状动脉瘤，这部分患儿的愈后，要决定于冠状动脉病变恢复的情况。如果短期随访冠状动脉病变可以逐渐的恢复，这部分患儿是可以痊愈，如果出现严重的冠状动脉病变，后期冠状动脉病变不可以恢复，成为心脏的后遗症，这部分川崎病的患儿可能也遗留相关的心血管的后遗症。
