白塞病的治疗分为对症治疗、内脏血管炎和眼炎的治疗。
对症治疗中，根据病人的不同临床症状而应用不同的药物，对于关节炎一般是非甾体抗炎药，秋水仙碱有一定疗效，另外，对于结节红斑秋水仙碱也可能有效，对于口腔溃疡，包括秋水仙碱，糖皮质激素制剂的局部应用都是可行。另外对于葡萄膜炎可以使用眼药水或眼药膏，进行一些相应的对症治疗，沙利度胺对于粘膜溃疡有较好的疗效。
如果病人一旦出现内脏血管炎，主要治疗就是糖皮质激素和免疫抑制剂，可以根据病变部位，进展来选择药物的种类和剂量。除此之外，对于新发后葡萄膜炎以及顽固的后葡萄膜炎，神经白塞血管，白塞肠白塞，还有皮肤粘膜受累，关节炎，经常规治疗也就是糖皮质激素，还有免疫抑制剂的治疗无效情况下，可考虑使用肿瘤坏死因子拮抗剂。
另外，近年来还有白介素6单抗对于眼部病变，肠白塞，血管白塞也是有效的报道。对于出现动脉瘤的患者，一般可以结合临床给予介入治疗或者手术切除。
